1）对其它颠茄生物碱不耐受者，对本品也不耐受。
2）孕妇静脉注射阿托品可使胎儿心动过速。
3）本品可分泌入乳汁，并有抑制泌乳作用。
4）婴幼儿对本品的毒性反应极有敏感，特别是痉挛性麻痹与脑损伤的小儿，反应更强，环境温度较高时，因闭汗有体温急骤升高的危险，应用时要严密观察。
5）老年人容易发生抗M胆碱样副作用，如排尿困难、便秘、口干（特别是男性），也易诱发未经诊断的青光眼，一经发现，应即停药。本品对老年人尤易致汗液分泌减少，影响散热，故夏天慎用。
6）下列情况应慎用：
（1）脑损害，尤其是儿童；
（2）心脏病，特别是心律失常，充血性心力衰竭、冠心病、二尖瓣狭窄等；
（3）反流性食管炎、食管与胃的运动减弱、下食管扩约肌松弛，可使胃排空延迟，从而促成胃潴留，并增加胃-食管的反流；
（4）青光眼患者禁用，20岁以上患者存在潜隐性青光眼时，有诱发的危险；
（5）溃疡性结肠炎，用量大时肠能动度降低，可导致麻痹性肠梗阻，并可诱发加重中毒性巨结肠症；
（6）前列腺肥大引起的尿路感染（膀胱张力减低）及尿路阻塞性疾病，可导致完全性尿潴留。
7）对诊断的干扰：酚磺酞试验时可减少酚磺酞的排出量。
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