疑难病研究之:板层状鱼鳞病TGM1基因突变的研究
2018年09月28日 1683人阅读 返回文章列表
板层状鱼鳞病TGM1基因突变的研究广东省妇幼保健院儿童遗传代谢内分泌科刘舒
刘 舒
发表于《中华全科医学》杂志2014年第6期
先天性常染色体隐性遗传性鱼鳞病(Autosomal recessive congenital ichthyosis,ARCI)是一组以皮肤角化功能障碍为特点的罕见遗传性皮肤疾病的统称[1-2]。板层状鱼鳞病(Lamellar ichthyosis,LI;OMIM 242300)是常染色体隐性遗传性鱼鳞病的一种亚型,发病率约为1/30万,目前国内唯有数例病案报道 [3]。LI的主要致病基因为编码转谷氨酰胺酶1(transglutaminase,TGase-1)的TGM1基因(Gene ID:7051)[4-5]。人类TGM1基因有15个外显子,其编码区为第2~15外显子,编码817个氨基酸,TGM1突变所导致的鱼鳞病占全部ARCI发病率的38%-55%,占LI发病率的90%以上[6]。 本研究中,我们对一个板层状鱼鳞病家系的临床表型进行报道,并对先证者及家系成员进行TGM1基因的编码区、非翻译区(UTR)及外显子-内含子交界区进行检测,确定其基因突变位点。
1 资料与方法
1.1 临床资料 先证者女,2岁,出生时全身被覆薄膜,一个月后逐渐脱落,全身皮肤潮红、覆有鳞屑。随年龄增长,鳞屑渐增厚,色深,且皮肤脱屑反复发生,并出现指、趾因角化明显而呈挛缩状。头发及眉毛稀疏,指、趾挛缩,运动功能受限。全身以颈背为著被覆大片状灰褐色鳞屑,中央黏着,边缘游离,掌跖角化过度,指、趾甲略增厚。患儿经两名皮肤科医师诊断为板层状鱼鳞病,且组织病理学示表皮明显角化过度,棘层稍肥厚,真皮浅层少量淋巴细胞浸润,未见毛囊附属器,确诊为该病。患者父母否认近亲结婚及家族中有类似病史。
1.2 实验方法 经签署知情同意书后,采集板层状鱼鳞病患儿、家系成员(父母)以及50名家系外正常人的静脉血2 mL。基因组DNA 抽提使用Qiagen 试剂盒。利用primer premier 5.0设计TGM1基因编码区、非翻译区及外显子-内含子交界处剪切位点的引物(表1)。物种保守性分析于http://www.mutationtaster.org/,用PyMOL软件分析蛋白三级结构。
2 结果
2.1 TGMI1基因突变检测 先证者同时存在两个不同位点的杂合性错义突变,其中位于第3外显子的突变c.424C>T(图1),使第142位密码子CGC变为TGC,导致精氨酸(R)转变为半胱氨酸(C),即p.R142C;而第6外显子的c.967C>T杂合错义突变(图2),使第323位密码子CGG转变为TGG,导致精氨酸(R)转变为色氨酸(W),即p.R323W。先证者的父母表型正常,但母亲携带c.424C>T,父亲携带c.967C>T。反向测序也证实此两个突变位点。50名家系外正常人DNA测序未发现相应突变。
2.2 生物信息学分析 TGM1基因编码TGase-1蛋白的第142位和第323位精氨酸(R)在不同物种(人类、灵长类、犬属、小鼠、大鼠和果蝇)中完全相同。突变p.R142C和p.R323W使高度保守的氨基酸发生了置换,且前者位于N末端的转谷氨酰胺酶功能域,后者位于N末端的转谷氨酰胺酶功能域与转酰胺作用催化核心功能域之间。结构预测发现TGase-1野生型蛋白中,R142胍基的两个电负性较强的氨基氮原子与Y134酚基的羟基氢原子形成氢键, R323胍基氢原子和氮原子分别与G473羰基氧原子、D490羧基氢原子形成氢键,而突变后上述位点之间无法形成氢键(图3-4),可能影响该蛋白的生物学功能。
3 讨论
Huber等首次发现位于染色体14q11上的TGM1基因是板层状鱼鳞病的致病基因[1],其编码转谷氨酰胺酶1(TGase-1)。TGase-1蛋白由二聚体构成,每个单体包含四个功能域,分别是N末端的转谷氨酰胺酶功能域、转酰胺作用催化核心功能域和两个C末端转谷氨酰胺酶功能域(β-barrel 1和β-barrel 2)[7-8]。 TGase-1蛋白具有转移氨基酸到蛋白质的谷氨酸残基上形成异肽键的能力,参与角质包膜形成过程中ε-(γ谷氨酰)赖氨酸交联的形成[9],是皮肤屏障功能的物质基础。
本家系中,患儿突变c.424C>T(R142C)来自母亲,Nakagawa[10]等研究表明该突变直接导致了酶的稳定性降低,严重影响了小鼠角质层的发育和皮肤屏障功能建立。TGase-1蛋白的第142位精氨酸的两个氨基形成的氢键是其氨基端β折叠和酶接触反应中心功能区连接的最关键的功能键之一,氢键的丧失可能使TGase-1蛋白的结构破坏而导致整个酶无活性。而来自父亲的另一突变c.967C>T使第323位极性氨基酸R变为非极性氨基酸W,无法与第473位甘氨酸和第490位天冬氨酸形成氢键,且Herman[9]报导该突变改变了TGase-1酶的转酰胺作用催化核心功能域活性位点的总电荷分布,可能使酶的结构破坏,从而影响其与底物的相互作用,导致TGasel活性降低或失去活性。
本研究首次发现板层状鱼鳞病患者同时存在TGM1基因的两个复合性杂合突变c.424C>T (p.R142C)和c.967 C>T (p.R323W),对于进一步明确TGMl基因型与LI临床表型之间的联系具有一定的意义,并且为该家庭行产前诊断奠定基础。
参考文献
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[10] Nakagawa N, Yamamoto M, Imai Y, et al. Knocking-in the R142C mutation in transglutaminase 1 disrupts the stratum corneum barrier and postnatal survival of mice[J].J Dermatol Sci,2012,65(3):196-206.