确定了139个与静脉曲张相关的遗传风险位点
2023年01月11日 93人阅读 返回文章列表
确定了 139 个与静脉曲张相关的遗传风险位点
隶属于米国众多医学研究机构的一组研究人员已经确定了 139 个与静脉曲张相关的遗传风险位点
。
在他们发表在《自然·心血管研究》杂志上的论文中,该小组描述了对来自米国百万退伍军人计
划 ( U.S. Veterans Million Veteran Program, VMVP) 的数据的分析,以及来自其他四个大型
生物库的信息以及该研究表明的关于静脉曲张多基因结构的信息。
由于导致血液流动不当的瓣膜问题,静脉曲张变大。病情的严重程度从难看和烦人到危及生命不
等。最常见的治疗方法之一是硬化疗法,将生理盐水溶液注入静脉,防止它们再充盈血液。
在这项新的研究中,研究人员指出,静脉曲张是心血管疾病的常见原因,但目前治疗很少。
研究人员还指出,先前的研究表明静脉曲张是可遗传的,并且已经确定了几个危险因素,但迄今
为止,对静脉曲张出现背后的遗传学知之甚少。研究人员试图了解更多与这种情况相关的风险位
点。
研究人员搜索了来自 VMVP 的数据以及来自其他四个大型生物样本库的数据,以寻找与 49,765
名静脉曲张患者相关的遗传因素的证据。
他们能够识别出涉及 139 个风险位点的 8,300 个变异。研究人员还能够确定静脉曲张和其他血
管疾病之间的遗传重叠。
研究人员将他们的分析与其他工具相结合,例如表观遗传图谱的开发,并且能够识别出一些参与
静脉曲张发展的生物学过程。
他们得出结论,涉及发展静脉曲张的遗传风险与许多其他特征共享,包括某些血管蛋白的特征。
他们进一步表明,这种情况既有主要原因也有次要原因,应该有可能在可能患这种情况的人身上
识别出标记物。
图:
全基因组重要静脉曲张变异的基于重启的拓扑基因富集随机游动。a) 细胞类型特异性 SNP 基因
分配和基因集富集分析的工作流程。Hi-C 接触图由人脐静脉内皮细胞 (HUVEC) 和人冠状动脉平
滑肌细胞 (HCASMC) 以及来自 HUVEC 和 HCASMC Hi-C 数据集的交叉 H-MAGMA 指定基因生成。b)
与基于与每个 GO 术语相关的基因的随机游走重新启动 (RWR) 排名的其他 GO 术语相比,与已知
心血管过程相关的 GO 术语相比,静脉曲张 GWAS 基因在拓扑上更加丰富。
附原研究概要
静脉曲张是心血管疾病发病的常见原因,可用的药物疗法有限。
尽管静脉曲张是可遗传的,并且流行病学研究已经确定了几个候选的静脉曲张危险因素,但分子
和遗传基础仍然不确定。
在这里,研究人员使用退伍军人事务部百万退伍军人计划和其他四个大型生物库的数据分析了常
见基因变异对静脉曲张的影响。
在 49,765 名静脉曲张患者和 1,334,301 名无病对照者中,研究人员确定了 139 个风险位点。
研究人员确定了静脉曲张、其他血管疾病和数十种人体测量因素之间的遗传重叠。
使用孟德尔随机化,研究人员通过整合蛋白质组学和转录组学数据来确定治疗目标的优先级。
最后,拓扑富集分析证实了内皮剪切流破坏、炎症、血管重塑和血管生成的生物学作用。这些发
现可能会促进未来开发静脉曲张非手术疗法的努力。
通讯作者单位:
通讯作者:Scott M. Damrauer
米国费城 Corporal Michael J. Crescenz VA 医疗中心,
米国宾夕法尼亚州费城,宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院遗传学系
米国宾夕法尼亚州费城,宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院外科